校内合作：

物理机电学院

化学化工学院

生命科学学院

药学院

公共卫生学院

材料学院

计算机学院

国内合作：

北京大学干细胞研究中心

北京同仁眼科医院

温州医学院眼视光研究所

复旦大学眼耳鼻喉科医院

中山大学中山眼科中心

第三军医大学

国外合作：
眼科战略联盟:
Harvard University
Osaka University
Xiamen University

主办国际国内学术会议:

•2010年第五次全国干眼学习班

•2010年大阪大学&厦门大学眼表研究论坛

•2011年第三届中华眼科中青年论坛

•2011年第四届闽西南眼科学术会议

•2012年全国眼科实验室PI会议

•2013年全国眼科年会

•2014年眼表高峰论坛

•2013-2015年厦门大学-哈佛大学年度眼科视频学术会议

•2015年第三届哈佛-大阪-厦门大学眼科学术论坛

•2015年第一届全国干眼学术会议

•2016年第一届亚洲干眼学术会议

国际学术交流:

•世界眼科大会

•亚太眼科年会

•美国眼科与视觉科学大会

•美国临床眼科大会

•亚洲角膜学术会议

•中日韩眼科学术会议